La UNESCO es la única agencia de las Naciones Unidas que tiene una red mundial de organismos nacionales de cooperación conocidos como Comisiones Nacionales para la UNESCO. Establecidos por sus respectivos gobiernos de acuerdo con el Artículo VII de la Constitución de la UNESCO, actualmente existen 199 Comisiones Nacionales para la UNESCO en todo el mundo.
La Comisión Nacional Helénica para la UNESCO fue establecida por Ley en 1991 (Gaceta del Gobierno 173 el 20 de noviembre de 1991 sobre la «Ratificación de la Carta de Comisiones Nacionales para la UNESCO y la creación de la Comisión Nacional Griega para la UNESCO») y está supervisada por la Ministerio Helénico de Asuntos Exteriores.
Los órganos rectores son: el Presidente, el Consejo de Administración y la Asamblea General, integrados por 130 miembros, entre ellos académicos, representantes de ministerios, funcionarios educativos, instituciones culturales y de investigación y personalidades destacadas. Desde octubre de 2004, el cargo de Presidente lo ocupa la Sra. Aikaterini Tzitzikosta.
Las prioridades clave de la Comisión Nacional Helénica son el fortalecimiento de las relaciones de la UNESCO con todos los interesados a nivel nacional, regional e internacional, la promoción de la creación de redes, la cooperación con organizaciones gubernamentales y no gubernamentales y la sociedad civil. Más específicamente, la Comisión Nacional Helénica para la UNESCO está en estrecha cooperación con los seis ministerios para la implementación de los proyectos e iniciativas. La Comisión Nacional Helénica para la UNESCO, entre otras, organiza conferencias y talleres internacionales en las áreas prioritarias de la UNESCO, otorga sus auspicios en programas educativos, culturales, ambientales y científicos, participa y está representada en importantes conferencias y foros internacionales, desarrolla nuevas asociaciones con el sector privado, otorga premios, establece Cátedras UNESCO en universidades griegas y establece numerosas redes UNESCO, tales como Redes entre ciudades y Redes entre 150 escuelas asociadas.